（1）平等原則
   
    供應(yīng)鏈成員企業(yè)，無論規(guī)模大小，實力強(qiáng)弱，在合作中的地位和對利益追求的權(quán)力是平等的。平等原則是利益分配的最基本的原則，如果供應(yīng)鏈企業(yè)相互間不平等，那么就不可能形成長期的合作關(guān)系，也不能使整個供應(yīng)鏈保持高效的運營，也就不能實現(xiàn)供應(yīng)鏈最大利益。
   
    （2）公平兼顧效率的原則
   
    供應(yīng)鏈企業(yè)是作為一個整體開展活動的，企業(yè)間存在著復(fù)雜的相互關(guān)聯(lián)的工作內(nèi)容，需要各成員企業(yè)的相互協(xié)同工作，公平有助于企業(yè)間的團(tuán)結(jié)精神，避免企業(yè)間過度競爭和隔閡，從而影響整個供應(yīng)鏈的績效。但對這個問題也要辯證的看待，因為過分的公平可能會挫傷供應(yīng)鏈中最優(yōu)秀企業(yè)的積極性，所以必須在公平和效益之間找一個平衡，即公平也兼顧效益。
   
    （3）互惠互利的原則
   
    所謂的互惠互利是指在企業(yè)合作過程中，要保證每個成員企業(yè)都能從成功后的供應(yīng)鏈中獲取相應(yīng)的利益，否則將會損害成員企業(yè)的積極性。在博弈論中己經(jīng)證明，要保證聯(lián)盟的穩(wěn)定性，必須保證加入供應(yīng)鏈后企業(yè)從供應(yīng)鏈中獲取的利益要大于不加入供應(yīng)鏈的利益，否則成員企業(yè)就不會加盟供應(yīng)鏈企業(yè)。只有互惠互利才能謀求長久、穩(wěn)定的共同發(fā)展，無原則的侵占其它企業(yè)應(yīng)得的利益，會損壞合作關(guān)系的融洽，最終會使合作關(guān)系破裂。
   
    （4）協(xié)商讓利原則
   
    在利益分配中過程中，最容易產(chǎn)生分歧引起糾紛的，是在實踐中出現(xiàn)的協(xié)議中又無規(guī)定的或規(guī)定不明確的新利益。這時，應(yīng)本著實事求實、充分協(xié)商的原則解決。因為任何一個成員如果因不滿而退出都會導(dǎo)致聯(lián)盟的破裂，必須通過高層間的談判及協(xié)商來解決利益分配問題。另外，當(dāng)實際利益分配明顯有利于某企業(yè)時，該企業(yè)應(yīng)適當(dāng)讓出一部分利益給利益分配明顯偏低的企業(yè)，以謀求共同發(fā)展。
   
    （5）利益與風(fēng)險掛鉤原則
   
    一般而言，成員企業(yè)所承擔(dān)的風(fēng)險越大，其所獲的利益也應(yīng)該越多，如果不考慮利益與風(fēng)險的相關(guān)性，企業(yè)將會缺乏動力去承擔(dān)風(fēng)險。目前，有學(xué)者采用模糊綜合評判方法來進(jìn)行合作伙伴市場、技術(shù)、合作等各類風(fēng)險系數(shù)的估算，據(jù)此求出伙伴總的風(fēng)險系數(shù)，并在計算各伙伴的總投資額的基礎(chǔ)上，利用風(fēng)險系數(shù)來確定各伙伴的收益分配比例。
   
    （6）民主決策原則
   
    供應(yīng)鏈企業(yè)的利益分配方案制定的過程是一個由眾多成員企業(yè)群體決策的過程。在決策過程中成員企業(yè)可以從自身的角度提出初始的利益分配方案，而核心企業(yè)則引導(dǎo)成員企業(yè)對所有初始方案進(jìn)行選擇或修改。供應(yīng)鏈企業(yè)利益分配方案的群體決策過程充分體現(xiàn)了決策的民主性，使得最后制定的利益分配方案更容易讓成員企業(yè)接受，對成員企業(yè)更具有鼓勵性。
   
    （7）科學(xué)分配原則
   
    制定供應(yīng)鏈企業(yè)利益分配方案是以科學(xué)的合作利益分配理論為基礎(chǔ)，而不是完全憑主觀判斷。以科學(xué)的理論為基礎(chǔ)制定的虛擬企業(yè)利益分配方案將更能讓成員企業(yè)接受。
   
    （8）信息透明原則
   
    信息溝通問題通常是引起矛盾的原因，因此，為了減少因信息溝通而造成的誤會和矛盾，供應(yīng)鏈核心企業(yè)在利益分配過程中應(yīng)及時披露利益分配的方案、計算方法等方面信息。
   
    另外，對利益分配應(yīng)該有廣義的認(rèn)識，利益分配不僅是指合作產(chǎn)品及其利潤的分配，而且還應(yīng)該包括聯(lián)盟所產(chǎn)生的專利權(quán)、技術(shù)訣竅、商標(biāo)、商譽等，也應(yīng)該對這些無形資產(chǎn)進(jìn)行科學(xué)的評估，為利益分配提供依據(jù)。
   
    從上面的分析我們可以看出公平分配是維系合作關(guān)系的關(guān)鍵，也就是確定合理的貢獻(xiàn)率值（第方對由方構(gòu)成的供應(yīng)鏈的整體收益的貢獻(xiàn)率，有。同一個企業(yè)在節(jié)點不同的供應(yīng)鏈中的分配率是不相同的；在相同的節(jié)點數(shù)、不同的節(jié)點構(gòu)成的供應(yīng)鏈中的分配率也是不同的），合作博弈理論正是解決這類問題的常用方法，我們根據(jù)博弈理論，按照Shapley值將合作收益均等地分配于各合作方，提出了供應(yīng)鏈利益分配方案實施的步驟：
   
    （1）供應(yīng)鏈各企業(yè)分別建立對外協(xié)調(diào)部門
   
    企業(yè)對外協(xié)調(diào)部門主要是處理本企業(yè)與其它企業(yè)之間的沖突，尤其是利益沖突，一般應(yīng)由企業(yè)的副總經(jīng)理負(fù)責(zé)。
   
    （2）各協(xié)調(diào)部門共同確定合作利益分配的原則
   
    古人曰：沒有規(guī)矩不成方圓。因此在進(jìn)行供應(yīng)鏈利益分割之前，應(yīng)該共同制定一個利益分配原則，以免以后引起糾紛無章可循。
   
    （3）選擇一個科學(xué)合理的利益分配方案
   
    利益分配原則只是一個總的指導(dǎo)原則，還不能根據(jù)這個原則進(jìn)行科學(xué)、合理的分配，因此，必須根據(jù)利益分配相關(guān)理論和模型，結(jié)合自己的實際情況，選擇一個適合自己的利益分配方案。
   
    （4）利益分配方案的實施
   
    確定了利益分配的原則和選擇了利益分配的模型后，供應(yīng)鏈核心企業(yè)就可具體實施利益了。
   
    （5）修正利益分配方案經(jīng)過初次的利益分配后，由于模型本身的不足或?qū)嶋H情況的復(fù)雜性，或由于其它的原因，可能造成利益分配的結(jié)果不太令人滿意，這時就需要供應(yīng)鏈各企業(yè)去協(xié)商解決，尤其是核心企業(yè)應(yīng)帶領(lǐng)成員企業(yè)共同協(xié)商去修正利益分配方案，盡量使各成員企業(yè)都認(rèn)為利益分配的公平性、合理性。